Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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