Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHD9Q3L8U1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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