Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN3Q16667 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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