Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NBR1Q14596 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NBR1Q14596 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms