Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTTNQ14247 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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