Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CKAP5Q14008 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms