Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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