Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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PTP4A2Q12974 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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