Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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FOXF2Q12947 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXF2Q12947 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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