Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC018638.6-201ENST00000605007 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC097534.2-204ENST00000608892 284 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC022558.3-201ENST00000616598 688 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL132996.1-201ENST00000569865 1431 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SNRPD1-204ENST00000582475 723 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL590408.1-201ENST00000430905 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RPS8P10-201ENST00000460876 622 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 INTS4-205ENST00000527522 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC135068.6-201ENST00000625294 622 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms