Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN17P56750 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms