Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ETV1P50549 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ETV1P50549 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETV1P50549 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ETV1P50549 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETV1P50549 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETV1P50549 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETV1P50549 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETV1P50549 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETV1P50549 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETV1P50549 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETV1P50549 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ETV1P50549 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ETV1P50549 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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