Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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