Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FNTBP49356 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms