Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP3P42574 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP3P42574 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP3P42574 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP3P42574 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP3P42574 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP3P42574 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP3P42574 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP3P42574 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP3P42574 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP3P42574 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms