Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC1P41238 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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