Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAV1P15498 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms