Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNFP01375 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFP01375 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFP01375 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFP01375 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms