Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms