Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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USP18Q9UMW8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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USP18Q9UMW8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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USP18Q9UMW8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP18Q9UMW8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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