Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCMF1Q9P0J7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms