Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ABCC13Q9NSE7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms