Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LHX9Q9NQ69 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LHX9Q9NQ69 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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