Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
USP29Q9HBJ7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP29Q9HBJ7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms