Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VN1R3Q9BXE9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms