Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP2Q9BX26 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms