Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOPXQ9BPY8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms