Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
JSRP1Q96MG2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms