Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NEDD1Q8NHV4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEDD1Q8NHV4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms