Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OPN5Q6U736 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OPN5Q6U736 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OPN5Q6U736 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms