Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEP170Q5SW79 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP170Q5SW79 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms