Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LACTB2Q53H82 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms