Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms