Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGSM1Q2NKQ1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms