Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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