Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKIV2LQ15477 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms