Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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