Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM28Q13263 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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