Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
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