Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms