Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE3AQ05086 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE3AQ05086 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms