Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
IRF8Q02556 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms