Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FAM3BP58499 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FAM3BP58499 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FAM3BP58499 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FAM3BP58499 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FAM3BP58499 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FAM3BP58499 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FAM3BP58499 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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FAM3BP58499 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FAM3BP58499 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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FAM3BP58499 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3BP58499 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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