Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRCA2P51587 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms