Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GSK3BP49841 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms