Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1EP49674 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms