Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC1A1P43005 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms