Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPREP23469 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPREP23469 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPREP23469 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms