Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RGPD2P0DJD1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms