Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SMIM1B2RUZ4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms